Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3C2AO00443 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3C2AO00443 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms