Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLRMTO00411 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms