Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01387J3KSC0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms