Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms