Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4E171 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4E171 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4E171 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4E171 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4E171 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4E171 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4E171 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4E171 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4E171 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4E171 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4E171 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4E171 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms