Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF879B4DU55 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF879B4DU55 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms