Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC169A6NNP5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms