Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM247A6NEH6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms