Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA3AA6NCI4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms