Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms