Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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IGHV3-16A0A0C4DH30 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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IGHV3-16A0A0C4DH30 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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