Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJA3Q9Y6H8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA3Q9Y6H8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms