Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
RAD54L2Q9Y4B4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RAD54L2Q9Y4B4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms