Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNIP3Q9Y2W7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms