Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KDM2AQ9Y2K7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM2AQ9Y2K7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms