Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms