Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDZRN3Q9UPQ7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms