Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms