Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALKQ9UM73 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALKQ9UM73 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms