Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms