Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALD1Q9ULE6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms