Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKLN1Q9UL63 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKLN1Q9UL63 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms