Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC9Q9UKV0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms