Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PACSIN3Q9UKS6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms