Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIMS3Q9UJD0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIMS3Q9UJD0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms