Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACL1Q9UJ83 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms