Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms