Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPN3Q9UHW5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms