Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPC1L1Q9UHC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPC1L1Q9UHC9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms