Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5BQ9UGL1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5BQ9UGL1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms