Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms