Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms