Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RRBP1Q9P2E9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRBP1Q9P2E9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms