Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIS18AQ9NYP9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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