Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms