Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM28Q9NW13 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM28Q9NW13 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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