Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LMBRD1Q9NUN5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms