Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms