Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCM1Q9NP62 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms