Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM27Q9HBJ8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms