Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY9Q9HBG7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY9Q9HBG7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms