Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKRIP1Q9H875 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms