Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCOLN1Q9GZU1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MCOLN1Q9GZU1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms