Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR1EQ9GZS1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR1EQ9GZS1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms