Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms