Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL3Q9BY60 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms