Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PECRQ9BY49 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PECRQ9BY49 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms