Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms