Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2AFJQ9BTM1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2AFJQ9BTM1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms