Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MCMBPQ9BTE3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms